Wagner-orgelet
Det berømte barokkorglet ble bygget av orgelbygger Joachim Wagner og sto ferdig oppsatt i kirken i 1741.
Wagner regnes som en av tysk barokks store orgelbyggere. Foruten dette instrumentet er det kun få av hans orgler som fortsatt er i behold, alle i området rundt Berlin. Wagner opplevde å få høre Bach spille på sine orgler i Potsdam. Mesteren skal ha var svært begeistret.Utover 1800-tallet ble Nidaros domkirkes Wagner-orgel flere ganger bygget om og tilpasset den tids nye klangideal. Dette innebar bl.a. at en del stemmer ble fjernet og andre endret.
Gjennom restaureringsarbeidet med selve katedralen ble dessuten orglet flyttet på en rekke ganger. Det var et gebrekkelig instrument som ble tatt ned for lagring i 1930. I 1994 ble orglet sendt til orgelfirma Jürgen Ahrend i Tyskland for restaurering og rekonstruksjon. Instrumentet er nå tilbakeført til sin originale disposisjon og stemmeprakt. Et nytt galleri ble satt opp i nordre tverrskip for å huse klenodiet.Wagner-orglet har 30 stemmer fordelt på to manualer og pedal.
Wagner-orgelet er internasjonalt kjent som et fremragende instrument for det klassiske repertoaret.